Contaminants alimentaires — analyse complète

Mycotoxines : aflatoxines, ochratoxine A
dans le café, les céréales et les fruits secs
— données EFSA et mesures pratiques

Les mycotoxines sont des toxines produites par des champignons microscopiques qui colonisent les aliments avant et après la récolte. L'aflatoxine B1 est le contaminant naturel le plus cancérogène connu pour l'humain — classé groupe 1 par le CIRC. Elle se trouve dans les céréales, les fruits à coque, les épices et le café que nous consommons quotidiennement. Cette page explique quelles mycotoxines méritent attention, dans quels aliments les retrouver et comment réduire raisonnablement son exposition.

Aflatoxine B1 : CIRC Groupe 1 Données EFSA · CIRC · ANSES Réglementation UE en vigueur

Qu'est-ce qu'une mycotoxine ?

Définition et origine

Le terme mycotoxine vient du grec mykes (champignon) et du latin toxicum (poison). Il désigne les métabolites secondaires produits par certains champignons filamenteux microscopiques — principalement des espèces des genres Aspergillus, Penicillium, Fusarium et Claviceps — lorsqu'ils colonisent des denrées alimentaires dans des conditions favorables (humidité, chaleur, stress hydrique des plantes). Les mycotoxines sont distinctes des toxines produites par les champignons comestibles macroscopiques — il s'agit ici de moisissures invisibles à l'œil nu qui peuvent contaminer un aliment sans que cela soit visible.

La contamination peut survenir avant la récolte (contamination au champ, souvent liée au stress hydrique ou aux insectes qui blessent les grains), pendant le séchage (conditions d'humidité insuffisantes) ou pendant le stockage (humidité relative de l'air trop élevée, température inadaptée). Une fois formées, la plupart des mycotoxines sont extrêmement stables : elles résistent à la cuisson, à la congélation, à la pasteurisation et à la plupart des traitements technologiques alimentaires.

Pourquoi les mycotoxines sont-elles préoccupantes ?

Contrairement à de nombreux contaminants d'origine industrielle qui peuvent être éliminés de la chaîne alimentaire par des mesures réglementaires strictes, les mycotoxines sont des contaminants naturels — leur présence dans l'environnement est impossible à supprimer, seulement à réduire et surveiller. Le changement climatique aggrave la situation en Europe : le réchauffement et les épisodes de sécheresse suivis de pluies créent des conditions de plus en plus favorables au développement de champignons producteurs d'aflatoxines dans des pays auparavant épargnés, dont la France méridionale et l'Italie du Nord.

L'EFSA surveille en continu les teneurs en mycotoxines dans l'alimentation européenne via le programme de surveillance RASFF (Rapid Alert System for Food and Feed) et publie des évaluations d'exposition régulières. Les dépassements de teneurs maximales conduisent à des alertes et des retraits de produits — le RASFF enregistre plusieurs centaines d'alertes mycotoxines par an au niveau européen.

Source : FAO/OMS 2022 · EFSA surveillance mycotoxines · RASFF annuel

Aflatoxines : le contaminant naturel le plus cancérogène connu

Classification CIRC et mécanisme cancérogène

L'aflatoxine B1 (AFB1), produite principalement par Aspergillus flavus et Aspergillus parasiticus, est classée cancérogène certain pour l'humain (CIRC groupe 1) depuis 1993. Elle est le cancérogène naturel chimique le plus puissant identifié à ce jour : sa dose efficace pour induire des tumeurs hépatiques est de l'ordre du nanogramme par kilogramme de poids corporel chez l'animal. Le mécanisme est direct : l'AFB1 est métabolisée dans le foie en un époxyde hautement réactif qui forme des adduits avec la guanine de l'ADN, induisant des mutations du gène TP53 à un codon spécifique (codon 249) — une signature mutationelle caractéristique du carcinome hépatocellulaire lié aux aflatoxines, distincte de celui induit par les virus hépatiques.

L'AFB1 agit en synergie avec le virus de l'hépatite B : une personne co-exposée à l'AFB1 et infectée par le VHB a un risque de carcinome hépatocellulaire 30 à 60 fois supérieur à celui d'une personne non exposée aux deux facteurs. C'est pourquoi 80 % des cancers du foie liés aux aflatoxines surviennent en Afrique subsaharienne et en Asie du Sud-Est — régions à forte prévalence du VHB et à déficit historique de contrôle des mycotoxines dans les aliments.

Aflatoxines en Europe et en France

En Europe, les aflatoxines sont principalement importées avec des matières premières d'origine tropicale : maïs, arachides, pistaches, figues sèches, épices (piment, paprika, muscade). La réglementation européenne fixe des teneurs maximales très strictes et un dispositif de contrôle aux frontières robuste — ce qui explique que l'exposition des populations européennes soit significativement plus faible qu'en Afrique ou en Asie.

Cependant, le changement climatique modifie ce tableau. Des études de l'EFSA (2012, mise à jour 2020) projettent une progression de la contamination par A. flavus dans les maïs et céréales cultivés en Europe méridionale et centrale d'ici 2030-2050. Les étés 2021 et 2022, particulièrement chauds et secs en France, ont conduit à des teneurs en aflatoxines inhabituelles dans certaines lots de maïs français. L'ANSES et FranceAgriMer surveillent ces évolutions.

Aflatoxine M1 dans le lait

Lorsque les vaches laitières consomment des aliments contaminés par AFB1, leur foie métabolise une partie en aflatoxine M1 (AFM1) qui passe dans le lait. L'AFM1 est classée CIRC groupe 1 (cancérogène certain). La limite réglementaire européenne est fixée à 0,05 µg/kg dans le lait de vache, et à 0,025 µg/kg dans les préparations pour nourrissons. Les contrôles réguliers sur les laits commercialisés en France montrent des dépassements rares — inférieurs à 2 % des échantillons selon les enquêtes DGCCRF.

Source : CIRC monographie vol. 82 (2002) · EFSA 2020 · ANSES · Règlement UE 1881/2006

Ochratoxine A : rénale, immuno-suppresseure, probablement cancérogène

Propriétés et classification

L'ochratoxine A (OTA) est produite principalement par Aspergillus ochraceus et Penicillium verrucosum. Elle est classée CIRC groupe 2B (peut-être cancérogène pour l'humain), sur la base de données animales montrant des tumeurs rénales chez plusieurs espèces et d'études épidémiologiques suggérant une association avec le carcinome des cellules urothéliales (tumeurs des voies urinaires) dans des régions à forte exposition (Balkans, certaines zones d'Europe de l'Est).

Ses effets les mieux documentés chez l'humain sont rénaux (néphrotoxicité chronique), immunosuppresseurs et tératogènes chez l'animal. La dose journalière tolérable provisoire établie par l'EFSA est de 120 ng/kg de poids corporel par semaine — une valeur souvent approchée chez les consommateurs réguliers de café, de vin rouge et de céréales en Europe.

Présence dans les aliments : café, céréales, vin rouge

L'OTA est présente dans une large gamme d'aliments couramment consommés en France. Le café constitue l'un des principaux contributeurs à l'exposition, avec des teneurs variables selon l'origine des grains et les conditions de séchage. Le café soluble (instantané) présente généralement des teneurs plus élevées que le café torréfié en grain. Le vin rouge est également une source significative — les raisins en cours de séchage pour les vins liquoreux (passerillage) sont particulièrement susceptibles d'être contaminés. Les céréales (blé, orge, seigle), les fruits secs (raisins secs, figues) et les épices complètent l'exposition quotidienne.

L'EFSA a estimé en 2020 que l'exposition moyenne des adultes européens à l'OTA représente environ 50 à 90 % de la dose journalière tolérable hebdomadaire — un niveau qui laisse peu de marge, en particulier pour les grands consommateurs de café ou de vin rouge.

Source : EFSA Journal 2020;18(2):5997 · CIRC groupe 2B · ANSES avis OTA 2023

Autres mycotoxines importantes : DON, zéaralénone, fumonisines, patuline

Déoxynivalénol (DON) — céréales européennes

Le DON (également appelé vomitoxine) est produit par Fusarium graminearum et F. culmorum, champignons courants dans les céréales cultivées en climat tempéré humide — dont la France. Il est l'une des mycotoxines les plus fréquentes dans le blé, l'orge et le maïs européens. Le DON est classé non cancérogène mais provoque des nausées, vomissements et diarrhées à des doses élevées (toxicité aiguë), et une immunosuppression à des doses chroniques sub-aiguës. L'EFSA a établi une dose journalière tolérable provisoire de 1 µg/kg de poids corporel.

L'étude EFSA (2017, mise à jour 2022) montre que l'exposition au DON de la population européenne dépasse la dose journalière tolérable chez 5 à 30 % des enfants selon les pays — les enfants sont plus exposés en raison de leur consommation plus élevée de produits céréaliers rapportée au poids corporel. En France, les enfants de 3 à 10 ans présentent les expositions les plus élevées.

Zéaralénone (ZEN) — perturbateur endocrinien naturel

La zéaralénone est un œstrogène fongique produit par Fusarium dans les céréales, particulièrement le maïs. Elle se lie aux récepteurs aux œstrogènes et peut induire des effets de perturbation endocrinienne à des doses environnementales : puberté précoce chez les jeunes filles, perturbations de la fertilité. Les études épidémiologiques restent limitées mais l'EFSA a classé la ZEN comme perturbateur endocrinien potentiel en 2017. Des teneurs maximales ont été fixées dans les céréales et les aliments à base de céréales pour jeunes enfants.

Fumonisines (FB1, FB2) — maïs

Les fumonisines sont produites par Fusarium verticillioides dans le maïs, principalement dans les régions chaudes. La fumonisine B1 est classée CIRC groupe 2B (peut-être cancérogène). Les fumonisines sont associées à des cancers de l'œsophage dans des régions d'Afrique et d'Amérique latine où la consommation de maïs contaminé est élevée. En Europe, les teneurs sont généralement contrôlées, mais les étés chauds récents ont augmenté les dépassements dans le maïs français méridional.

Patuline — jus de pomme et compotes

La patuline est produite par Penicillium expansum dans les pommes abîmées, les poires et les cerises. Elle se retrouve principalement dans les jus de pomme et les compotes industriels fabriqués à partir de fruits partiellement endommagés. Classée non cancérogène par le CIRC mais mutagène in vitro, la patuline est réglementée à 50 µg/kg dans les jus de pomme (10 µg/kg dans les jus et compotes pour nourrissons). Les produits à base de fruits frais entiers ou de pommes entières visiblement saines présentent un risque négligeable.

Source : EFSA avis DON 2022 · EFSA avis ZEN 2017 · EFSA avis fumonisines 2018 · EFSA avis patuline 2004

Aliments les plus concernés : tableau de référence

Aliment Mycotoxine principale Niveau de préoccupation Remarque pratique
Arachides, pistaches Aflatoxines (AFB1, AFB2) Élevé si importées hors UE Préférer les produits avec certification UE. Jeter ceux à goût amer ou à moisissures visibles.
Maïs et produits dérivés Aflatoxines · Fumonisines · DON · ZEN Modéré à élevé selon origine Contrôles UE stricts. Maïs des pays à forte chaleur estivale plus à risque.
Blé, orge, seigle DON · ZEN · OTA Modéré — surveillance régulière DON fréquent après étés humides. Produits bio non nécessairement moins contaminés.
Café (grain et soluble) Ochratoxine A Modéré — variable selon origine Café soluble souvent plus contaminé. Arabica généralement moins que Robusta. Torréfaction réduit partiellement l'OTA.
Figues sèches, raisins secs Aflatoxines · OTA Modéré — surveiller l'aspect Éviter les fruits secs mous, collants ou à odeur suspecte. Stocker au frais et à l'abri de l'humidité.
Épices (paprika, piment, muscade) Aflatoxines · OTA Modéré — très variable selon lot Acheter en petites quantités, stocker au sec. Attention aux épices en vrac de provenance non contrôlée.
Vin rouge, raisins Ochratoxine A Faible à modéré Vins de régions chaudes (Midi, Italie) légèrement plus concernés. Vins liquoreux (passerillage) plus à risque.
Jus de pomme, compotes Patuline Faible — contrôles stricts UE Jus industriels sont contrôlés. Jus artisanaux de fruits abîmés potentiellement plus exposés.
Céréales petit-déjeuner DON · ZEN Modéré — surtout pour les enfants Varier les sources de céréales. Les enfants représentent la population la plus exposée au DON.

Réglementation européenne : teneurs maximales en vigueur

L'Union européenne dispose du système de réglementation des mycotoxines alimentaires le plus strict au monde, via le Règlement (CE) n° 1881/2006 modifié à plusieurs reprises. Ce règlement fixe des teneurs maximales pour les aflatoxines totales, l'ochratoxine A, le DON, la zéaralénone, les fumonisines et la patuline dans les principales catégories d'aliments. Des contrôles sont effectués aux frontières (aliments d'importation) et sur le marché intérieur par les autorités nationales (DGCCRF en France).

Mycotoxine Aliment Teneur maximale (µg/kg)
Aflatoxine B1 Céréales pour consommation humaine directe 2
Aflatoxines totales Arachides transformées pour consommation directe 4
Aflatoxine M1 Lait de vache 0,05
Ochratoxine A Céréales non transformées 3
Ochratoxine A Café torréfié 5
Ochratoxine A Vin 2
DON Céréales non transformées (sauf blé dur, avoine) 1 250
Zéaralénone Maïs non transformé 350
Fumonisines totales Maïs non transformé 4 000
Patuline Jus de fruits et produits de pomme 50
Contrôles aux frontières : le système RASFF (Rapid Alert System for Food and Feed) notifie en temps réel les dépassements détectés dans les aliments importés. En 2023, les mycotoxines constituaient la deuxième catégorie de notifications RASFF après les résidus de pesticides. Les principaux aliments à risque interceptés sont les figues sèches et pistaches de Turquie, le maïs d'Argentine et d'Ukraine, et les épices d'Inde et d'Indonésie.
Source : Règlement UE 1881/2006 consolidé · RASFF annuel 2023 · DGCCRF bilan annuel

Réduire son exposition : mesures pratiques fondées

Priorité — Règle moisissures visibles

Jeter les aliments mous ou humides moisis, couper pour les durs

La règle pratique validée par l'ANSES et l'USDA : pour les aliments à texture dense et faible humidité (fromages à pâte dure type comté, carottes, pommes entières, charcuteries sèches), couper 2 à 3 cm au-delà de la moisissure visible peut être suffisant — les mycotoxines diffusent peu dans les matrices denses. Pour tous les aliments mous, humides ou poreux (pain, fromage frais, yaourts, fruits mous, légumes cuits, confitures entamées, jus), jeter l'intégralité immédiatement — les mycotoxines ont diffusé bien au-delà de la partie visible.

Réduction du risque d'ingestion de mycotoxines concentrées
01

Stocker les fruits à coque et fruits secs au frais et à l'abri de l'humidité

Arachides, pistaches, noix du Brésil, figues sèches, raisins secs : les stocker dans un récipient hermétique au réfrigérateur ou dans un endroit frais et sec. Éviter les achats en grande quantité stockés dans des sacs ouverts à l'air. Jeter immédiatement tout fruit à coque présentant un goût amer ou une odeur de moisi — les aflatoxines ont un goût caractéristique à concentration élevée.

Réduction de l'exposition aux aflatoxines
02

Préférer le café arabica en grain, torréfaction standard

Le café arabica contient généralement moins d'OTA que le robusta. Le café soluble (instantané) concentre davantage les mycotoxines que le café filtré classique. La torréfaction standard réduit partiellement l'OTA. Une consommation modérée (1 à 2 tasses par jour) pour les adultes en bonne santé représente une exposition à l'OTA en deçà de la dose journalière tolérable hebdomadaire de l'EFSA. Pour les femmes enceintes, l'ANSES recommande de limiter le café à 200 mg de caféine par jour toutes sources confondues.

Réduction de l'exposition à l'ochratoxine A
03

Varier les sources de céréales pour les enfants

Le DON et la zéaralénone touchent particulièrement le blé et le maïs. Pour les enfants, varier les sources de glucides complexes (quinoa, sarrasin, riz, légumineuses en complément des céréales classiques) réduit l'exposition chronique au DON, notamment pour les enfants qui consomment beaucoup de pâtes, pain et céréales de petit-déjeuner au quotidien.

Réduction de l'exposition au DON chez les enfants
04

Acheter les épices en petites quantités chez des fournisseurs contrôlés

Les épices en vrac de provenance non traçable présentent un risque de contamination plus élevé. Préférer les épices conditionnées avec mention d'origine, en petites quantités pour éviter un stockage long. Les épices biologiques ne sont pas systématiquement moins contaminées — privilégier les fournisseurs qui publient leurs analyses mycotoxines (certains le font sur demande pour les professionnels de la restauration).

Réduction du risque aflatoxines et OTA via les épices
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Utiliser des récipients hermétiques pour les céréales et légumineuses sèches

Une fois les emballages ouverts, stocker farines, céréales, légumineuses et fruits secs dans des récipients hermétiques au sec et à l'abri de la chaleur. L'humidité relative idéale pour le stockage des céréales est inférieure à 70 %. Les greniers ou caves humides sont à proscrire. Les farines stockées longtemps dans leur emballage papier dans un placard humide sont plus exposées au développement de moisissures.

Prévention du développement de moisissures lors du stockage
Questions fréquentes

Mycotoxines : réponses aux questions courantes

Cela dépend de la texture et de l'humidité de l'aliment. Aliments durs et peu humides (fromage à pâte dure, carotte, pomme entière, charcuterie sèche) : couper 2 à 3 cm autour et sous la moisissure peut être suffisant. Aliments mous, humides ou poreux (pain, fromage frais, yaourt, fruit mou, légume cuit, confiture, jus) : jeter l'intégralité. Les mycotoxines diffusent bien au-delà de la zone visible dans les matrices molles et humides.

Source : ANSES · USDA Food Safety and Inspection Service

Partiellement. La torréfaction détruit 40 à 80 % des aflatoxines selon le degré de chauffe, mais n'élimine pas complètement l'ochratoxine A, qui résiste mieux à la chaleur (réduction de 10 à 50 % seulement). Le café soluble, qui subit des traitements supplémentaires, peut paradoxalement concentrer davantage l'OTA résiduelle. La réglementation européenne fixe des limites pour l'OTA dans le café torréfié (5 µg/kg) et le café soluble (10 µg/kg).

Source : EFSA · Règlement UE 1881/2006

Oui. Quand les vaches consomment des aliments contaminés par AFB1, elles métabolisent une partie en aflatoxine M1 (AFM1), classée CIRC groupe 1, qui passe dans le lait. La limite européenne est fixée à 0,05 µg/kg dans le lait (0,025 µg/kg dans les préparations pour nourrissons). Les contrôles DGCCRF montrent des dépassements rares en France (moins de 2 % des échantillons) grâce au système de contrôle des aliments pour animaux.

Source : CIRC · Règlement UE 1881/2006 · DGCCRF

Oui, la plupart résistent bien. Les aflatoxines sont stables jusqu'à 260-300 °C et ne sont pas éliminées par la cuisson normale. L'ochratoxine A et la zéaralénone sont également résistantes à la chaleur. La cuisson ne protège pas contre les mycotoxines — la prévention repose sur la qualité et la conservation des matières premières avant cuisson.

Source : EFSA · FAO · Revues 2018-2024

Les épices les plus fréquemment contaminées par les aflatoxines et l'OTA sont le piment rouge (paprika, chili), le poivre noir, la muscade, le curcuma, le gingembre et le cumin. Ces épices sont séchées dans des conditions pouvant favoriser Aspergillus. L'EFSA les identifie comme catégorie prioritaire de surveillance. Les épices bio ne sont pas nécessairement moins contaminées — la contamination dépend des conditions de récolte et de séchage.

Source : EFSA 2020 · RASFF

Pas systématiquement. Certaines études montrent des teneurs en DON légèrement plus élevées dans les céréales biologiques que conventionnelles, les fongicides de synthèse utilisés en conventionnel réduisant la croissance des Fusarium. L'EFSA conclut que les teneurs sont globalement comparables avec des variations importantes selon les années et régions. Le bio reste pertinent pour réduire l'exposition aux pesticides, mais ce n'est pas un avantage systématique pour les mycotoxines.

Source : EFSA · Études comparatives bio/conventionnel 2015-2022
Pour aller plus loin